Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tubb6Q922F4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms