Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nek8Q91ZR4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Nek8Q91ZR4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nek8Q91ZR4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nek8Q91ZR4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Nek8Q91ZR4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Nek8Q91ZR4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Nek8Q91ZR4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek8Q91ZR4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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