Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atl3Q91YH5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atl3Q91YH5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms