Protein–RNA interactions for Protein: Q91WJ8

Fubp1, Far upstream element-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp1Q91WJ8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fubp1Q91WJ8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fubp1Q91WJ8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms