Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usb1Q91W78 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usb1Q91W78 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usb1Q91W78 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usb1Q91W78 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usb1Q91W78 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usb1Q91W78 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usb1Q91W78 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Usb1Q91W78 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms