Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm39214-201ENSMUST00000210912 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms