Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms