Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Vmn1r200Q8R281 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vmn1r200Q8R281 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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