Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CipcQ8R0W1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CipcQ8R0W1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CipcQ8R0W1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CipcQ8R0W1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CipcQ8R0W1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CipcQ8R0W1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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