Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Scara5Q8K299 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms