Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gtf3c1Q8K284 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms