Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Afg3l2Q8JZQ2 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms