Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZK6

Trim61, MCG22896, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim61Q8JZK6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim61Q8JZK6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms