Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LgsnQ8CIX8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms