Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Phc3Q8CHP6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms