Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV2

Tph2, Tryptophan 5-hydroxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph2Q8CGV2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tph2Q8CGV2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms