Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE4

Scyl2, SCY1-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scyl2Q8CFE4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scyl2Q8CFE4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms