Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lrrc9Q8CDN9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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Lrrc9Q8CDN9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc9Q8CDN9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms