Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slfn5Q8CBA2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms