Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntrobQ8CB62 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CntrobQ8CB62 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms