Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Fbxo48Q8CAT8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Fbxo48Q8CAT8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms