Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
A430089I19RikQ8C9W1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
A430089I19RikQ8C9W1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms