Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Aph1bQ8C7N7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Aph1bQ8C7N7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Aph1bQ8C7N7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Aph1bQ8C7N7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Aph1bQ8C7N7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Aph1bQ8C7N7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Aph1bQ8C7N7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Aph1bQ8C7N7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Aph1bQ8C7N7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Aph1bQ8C7N7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Aph1bQ8C7N7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Aph1bQ8C7N7 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Aph1bQ8C7N7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Aph1bQ8C7N7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Aph1bQ8C7N7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Aph1bQ8C7N7 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Aph1bQ8C7N7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Aph1bQ8C7N7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Aph1bQ8C7N7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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