Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Usp20Q8C6M1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Usp20Q8C6M1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Usp20Q8C6M1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Usp20Q8C6M1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Usp20Q8C6M1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Usp20Q8C6M1 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Usp20Q8C6M1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Usp20Q8C6M1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp20Q8C6M1 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Usp20Q8C6M1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms