Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssuh2Q8C3L1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssuh2Q8C3L1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms