Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 1700047O18Rik-201ENSMUST00000209738 743 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Stfa2-201ENSMUST00000023619 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim35Q8C006 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm20830-202ENSMUST00000190426 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim35Q8C006 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim35Q8C006 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Trim35Q8C006 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim35Q8C006 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms