Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rbbp5Q8BX09 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms