Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pggt1bQ8BUY9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Pggt1bQ8BUY9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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