Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Abraxas1Q8BPZ8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Abraxas1Q8BPZ8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms