Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP27

Sfr1, Swi5-dependent recombination DNA repair protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfr1Q8BP27 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sfr1Q8BP27 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sfr1Q8BP27 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sfr1Q8BP27 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sfr1Q8BP27 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sfr1Q8BP27 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfr1Q8BP27 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfr1Q8BP27 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfr1Q8BP27 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfr1Q8BP27 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfr1Q8BP27 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfr1Q8BP27 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfr1Q8BP27 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfr1Q8BP27 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfr1Q8BP27 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfr1Q8BP27 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sfr1Q8BP27 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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