Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gga3Q8BMI3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gga3Q8BMI3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms