Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyp4f39Q8BGU0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms