Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q8BGC1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q8BGC1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms