Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc172Q810N9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc172Q810N9 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms