Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ttc28Q80XJ3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ttc28Q80XJ3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ttc28Q80XJ3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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Ttc28Q80XJ3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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Ttc28Q80XJ3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ttc28Q80XJ3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ttc28Q80XJ3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ttc28Q80XJ3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ttc28Q80XJ3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Ttc28Q80XJ3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ttc28Q80XJ3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ttc28Q80XJ3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Ttc28Q80XJ3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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