Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnma8aQ80VM8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms