Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek5Q7TSC3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek5Q7TSC3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek5Q7TSC3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek5Q7TSC3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek5Q7TSC3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek5Q7TSC3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek5Q7TSC3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek5Q7TSC3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nek5Q7TSC3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nek5Q7TSC3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms