Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS75

Amer1, APC membrane recruitment protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer1Q7TS75 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Amer1Q7TS75 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Amer1Q7TS75 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms