Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tnfsf18Q7TS55 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Tnfsf18Q7TS55 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms