Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Uhrf2Q7TMI3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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