Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ScocQ78YZ6 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScocQ78YZ6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms