Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Ncapd3Q6ZQK0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ncapd3Q6ZQK0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ncapd3Q6ZQK0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ncapd3Q6ZQK0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ncapd3Q6ZQK0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms