Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gja6Q6S5G4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gja6Q6S5G4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms