Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Zbtb39Q6PDK0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbtb39Q6PDK0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms