Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpa4Q6P8K8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpa4Q6P8K8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms