Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rrp12Q6P5B0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms