Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slx4Q6P1D7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms