Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HelbQ6NVF4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HelbQ6NVF4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms