Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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