Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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